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张璞,林育,游斌杰,孙静.猪的免疫球蛋白基因鉴定和注释[J].中国实验动物学报,2020,28(2):0.
猪的免疫球蛋白基因鉴定和注释
Identification and annotation of the porcine immunoglobulin genes
投稿时间:2019-07-31  
DOI:10. 3969 / j.issn.1005-4847. 2020. 02. 009
中文关键词:    免疫球蛋白  基因组
英文关键词:pig  immunoglobulin  genome
基金项目:
作者单位E-mail
张璞 四川农业大学畜禽品种资源发掘与利用省重点实验室,四川 611130 964057802@ qq.com 
林育 四川农业大学畜禽品种资源发掘与利用省重点实验室,四川 611130  
游斌杰 2. 重庆市畜牧科学院,重庆 402460
3. 农业部养猪科学重点实验室,重庆 402460
4. 养猪科学重庆市市级重点实验室,重庆 402460 
 
孙静 2. 重庆市畜牧科学院,重庆 402460
3. 农业部养猪科学重点实验室,重庆 402460
4. 养猪科学重庆市市级重点实验室,重庆 402460
5. 重庆市医用动物资源开发与利用工程技术研究中心,重庆 402460 
sunjing85026@ 163.com 
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中文摘要:
      目的 本研究旨在鉴定猪的免疫球蛋白基因,为研究猪对疾病的抗性奠定坚实的基础,同时对生猪养殖及其作为医学模式动物都有一定意义。 方法 使用 Blast+,R,DNAstar,WebLogo 等软件通过人免疫球蛋白基因信息对猪的免疫球蛋白基因进行预测分类。 结果 共鉴定到猪的免疫球蛋白重链(IGH)基因 43 个,分为 7 个基因家族;免疫球蛋白 κ 轻链(IGK)基因 27 个,分为 6 个基因家族;免疫球蛋白 λ 轻链( IGL)基因 25 个,分为 9 个基因家族。 结论 我们发现了 43 个猪免疫球蛋白重链基因,其中可能存在假基因。 同时猪免疫球蛋白两种轻链基因比例接近,这可能与其免疫特性有关,但仍需要相关的试验数据来开展研究。
英文摘要:
      Objective The aim of this study was to establish a basis for the identification of porcine immunoglobulin genes in order to facilitate research on swine disease resistance. Further improvements of immunoglobulin gene annotation will facilitate the development of the pig industry and will promote the wider application of pigs as a major biomedical model. Methods Porcine immunoglobulin genes were predicted and classified by comparison with human immunoglobulin genes using R, DNAstar, WebLogo, and Blast+. Results A total of 43 IGH, 27 IGK, and 25 IGL genes were identified in pigs, which could be divided into 7, 6, and 9 gene families, respectively. Conclusions We found 43 immunoglobulin heavy chain genes in pig. Some of them may be pseudogene. Meanwhile, the ratio of light chain genes (IGK ∶ IGL) is approximately 1 ∶ 1. It may be related to the immunological characteristics of pig, which need related experimental data to do its research.
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