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彭婉君,赵彬彬,武婧,陈鑫,牛栋,刘江宁.利用遗传多样性小鼠资源筛选 CA16 致病相关基因[J].中国实验动物学报,2020,28(2):0.
利用遗传多样性小鼠资源筛选 CA16 致病相关基因
Screening of CA16 pathogenicity-related genes using Genetic Diversity Mice
投稿时间:2019-12-27  
DOI:10. 3969 / j.issn.1005-4847. 2020. 02. 005
中文关键词:  柯萨奇病毒 A16 型  遗传多样性小鼠  致病相关基因
英文关键词:Coxsackievirus A16  Genetic Diversity Mice  pathogenicity-related genes
基金项目:
作者单位E-mail
彭婉君 北京协和医学院比较医学中心 中国医学科学院医学实验动物研究所, 国家卫健委人类疾病比较医学重点实验室,北京 100021 pwj199509@ 163.com 
赵彬彬 北京协和医学院比较医学中心 中国医学科学院医学实验动物研究所, 国家卫健委人类疾病比较医学重点实验室,北京 100021  
武婧 北京协和医学院比较医学中心 中国医学科学院医学实验动物研究所, 国家卫健委人类疾病比较医学重点实验室,北京 100021  
陈鑫 北京协和医学院比较医学中心 中国医学科学院医学实验动物研究所, 国家卫健委人类疾病比较医学重点实验室,北京 100021  
牛栋 北京协和医学院比较医学中心 中国医学科学院医学实验动物研究所, 国家卫健委人类疾病比较医学重点实验室,北京 100021  
刘江宁 北京协和医学院比较医学中心 中国医学科学院医学实验动物研究所, 国家卫健委人类疾病比较医学重点实验室,北京 100021 ljn_zb03038@ 126.com 
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中文摘要:
      目的 柯萨奇病毒 A16 型(Coxsachievirus A16,CA16)是手足口病主要致病病原体之一,其致病机制尚未明确。本研究利用遗传多样性小鼠(Genetic Diversity Mice)筛选 CA16 致病相关基因,深入研究该病毒的致病机制。 方法 选取 23 个遗传多样性小鼠品系为实验组,近交系 C57BL/ 6 小鼠为阴性对照组,均经腹腔感染 107 Copies CA16 病毒,取材血液和后肢骨骼肌样本,利用实时荧光定量 PCR 测定样本的病毒载量,之后利用 The Gene Mine 系统遗传学数据库分析感染数据,筛选获得 CA16 致病相关基因。 结果 依据感染小鼠血液和肌肉中病毒拷贝数均高于 104 Copies/ (μL/ mg)的筛选标准,得到 7 个对 CA16 易感的遗传多样性小鼠品系,且这些小鼠的骨骼肌组织表现出显著的病理损伤;同时基于 The Gene Mine 专业数据库的相应数据分析,发现小鼠 3 号及 4 号染色体与 CA16 致病最为相关,并最终筛选到 16 个可能与 CA16 致病相关的基因。 结论 遗传多样性小鼠资源为 CA16 致病相关基因研究提供新思路。
英文摘要:
      Objective Coxsackievirus A16 (CA16) is the main pathogenic pathogen of hand, foot and mouth disease (HFMD), but its pathogenic mechanism remains unclear. In this study, Genetic Diversity Mice were used to screen the pathogenic genes of CA16 and to explore the pathogenic mechanism. Methods Twenty-three strains of Genetic Diversity Mice were selected as the experimental group and C57BL/ 6 mice were used as the control group. Both groups were challenged with 107 copies of CA16 by intraperitoneal injection. Blood and hind limb skeletal muscle were collected, and the viral load was detected by real-time quantitative PCR. Then, the GeneMine systems genetics database was used to analyze data of infection and to screen CA16 pathogenicity-related genes. Results Seven mouse strains and 16 genes associated with CA16 were screened from the infection data of Genetic Diversity Mice. For all seven Genetic Diversity Mice strains, the viral loads in blood and muscles tissue were all >104Copie / (μL/ mg) and skeletal muscle showed significant pathological damage. Based on The GeneMine database, the pathogenicity-related genes were mainly distributed in chromosomes 3 and 4. Conclusions Genetic Diversity Mice resources provide a new method for the study of CA16 pathogenicity-related genes.
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