摘要:目的 对广西巴马小型猪组织蛋白酶K(cathepsin K,CTSK)基因CDS 区进行克隆及生物信息学分析。方法 从广西巴马小猪的皮下脂肪中提取总RNA,通过RT-PCR 方法扩增获得CTSK 基因CDS 区序列,并采用相关生物信息学软件对其序列特征、系统进化、编码蛋白结构和理化性质进行分析。结果 广西巴马小型猪CTSK 基因CDS 全长993 bp,编码330 个氨基酸,与NCBI 上公布的普通猪(NM_214302. 1)CTSK 基因序列完全一致。同源性比对结果发现,CTSK 基因在进化过程中具有较高的保守性。广西巴马小型猪CTSK 蛋白具有明显的亲水性区域,在第17-330 氨基酸位置区域存在一条信号肽序列,不存在跨膜结构域,二级结构元件由α 螺旋、β 折叠、无规卷曲和延伸链组成。修饰结构预测发现CTSK 蛋白存在两处N 糖基化位点,亚细胞定位发现其可能主要分布于内质网和细胞核。结论 本研究成功克隆了广西巴马小型猪CTSK 基因CDS 序列并进行分析,为今后进一步深入研究该基因功能和建立相关疾病动物模型提供理论基础。